Ketuhanan Yang Maha Esa merupakan jiwa dari seluruh falsafah dasar Negara Kesatuan Republik Indonesia. Ketuhanan tentu tidak terpisahkan dari aspek agama, maka dari itu bidang keagamaan merupakan aspek yang tidak terpisahkan dari kehidupan masyarakat dan Bangsa Indonesia. Dalam bidang keagamaan ini Yayasan Gema Insan Amanah menggulirkan program-progrma sebagai berikut:
Bantuan material untuk masjid yang sedang dibangun atau direnovasi. Program bantuan masjid ini merupakan program tahunan untuk masjid yang berada di plosok dan di tengah masyarakat yang tingkat ekonominya rendah.
2. Dzikir dan Doa Bersama
Kegiatan Dzikir dan doa bersama diselenggarakan setiap hari kamis malam bada maghrib.
3. Sedekah Membawa Berkah (SEMBARA)
Yayasan GIA menerima, mengelola dan mendistribusikan infak & sodaqoh baik dalam bentuk uang maupun barang kepada para mustahiq
5. PHBI dan Kegiatan keagamaan lainnya
6. Program spesial bulan Suci Ramadhan